Visi 
Satuan Pengawas Internal UNY memiliki visi sebagai berikut:
Menjadi Satuan Pengawas Internal yang profesional dan independen, memberikan nilai tambah dan meningkatkan kinerja UNY bidang non-akademik, serta mengawal terciptanya Good University Governance yang berlandaskan ketaqwaan, kemandirian, dan kecendekiaan.

Misi 

Satuan Pengawas Internal memiliki misi sebagai berikut :

1. Melaksanakan pengawasan internal atas aktivitas manajemen disemua unit kerja dilingkungan UNY terutama dibidang non-akademik (keuangan, aset, dan kepegawaian).

2. Menjadi mitra strategis bagi manajemen universitas dalam memberikan nilai tambah pada proses penyelenggaraan UNY terutama bidang non akademik.

3. Membantu pimpinan untuk mendapatkan penilaian yang obyektif dan berkualitas atas pelaksanaan kegiatan dimasing-masing unit kerja di lingkungan UNY bidang non akademik.

4. Mendorong pimpinan Universitas untuk meningkatkan penerapan tata kelola universitas yang baik (good university governance).